In-silico-Interaktion von bioaktiven Verbindungen gegen Pseudomonas spp

Verschiedene Stämme von Pseudomonas syringae befallen weltweit eine große Anzahl von Pflanzen. Dennoch bestand die Notwendigkeit, potenzielle bioaktive Verbindungen zu identifizieren, die mit Pseudomonas syringae reagieren und antimikrobielle Aktivität zeigen. Die Verbindungen aus 14 verschiedenen pflanzlichen Quellen, von denen bereits bekannt war, dass sie antibakterielle Eigenschaften haben, wurden virtuell gescreent, um nebenwirkungsfreie natürliche Arzneimittel zu identifizieren. Durch molekulares Docking wurden zwanzig potenzielle Verbindungen identifiziert (Procyanidin B2, Nimolicinol, Rutin, Xanthophyll, Withanolide, Hyperoside, Astragalin, Nimbaflavone, Tiplasinin, Chrysophanol, Emodin, 9,11-Dehydroergosterolperoxid, Ergosterolperoxid, Hämatoxylin, Ellagsäure, Liquiritin, Azadiradion, Meldenin, Vilasinin, Bergenin) eine perfekte Bindung mit dem berichteten HrcQB-Protein von Pseudomonas syringae-Bakterien gefunden. Die Ergebnisse zeigen, dass Procyanidin B2 die höchste Bindungsaffinität von -7,1 hat, an zweiter Stelle steht Nimolicinol mit einer Bindungsaffinität von -6,9 und dann Rutin und Xanthophyll mit einer Bindungsaffinität von -6,7.