Sequenzierung und genetische Charakterisierung

Die Banane (Gattung Musa) ist eine wichtige Wirtschafts- und Nahrungspflanze. Bananenpflanzen werden von vielen bakteriellen, pilzlichen und viralen Pathogenen befallen. Einer der wichtigsten viralen Krankheitserreger der Banane ist das Banana Bunchy Top Virus (BBTV), das die Banana Bunchy Top Disease (BBTD) verursacht. In Indien ist die Bananenindustrie seit Ende der 1980er Jahre mit dem Problem des BBTV konfrontiert, als eine schwere Epidemie drastische wirtschaftliche Verluste verursachte. Das Genom von BBTV besteht aus mindestens sechs integralen Komponenten zirkulärer einzelsträngiger DNA-Moleküle (cssDNA), die jeweils etwa 1 Kb groß sind. BBTV gehört zur Gattung Babuvirusin Nanoviridae, einer der drei cssDNA-Virusfamilien. Es wird von der Schwarzen Bananenblattlaus Pentalonia nigronervosa Coq übertragen. Die Informationen über BBTV in Kerala sind begrenzt. Es ist äußerst wichtig, das Virus, das die Bananenpflanzen in Kerala infiziert, zu isolieren und zu charakterisieren. Um das BBTV aus Kerala zu charakterisieren, wurde die DNA-R eines Isolats aus verschiedenen Distrikten in Kerala mittels PCR amplifiziert, kloniert und sequenziert. Die Analyse der genomischen Komponenten der DNA-R ergab Untergruppen von BBTV in Kerala. Auf der Grundlage der DNA-R gehören die Isolate aus Kerala zur südpazifischen Untergruppe.